Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPNP63162 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms