Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB1AP62820 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB1AP62820 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms