Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TMEM258P61165 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CACNB4-210ENST00000539935 8378 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
TMEM258P61165 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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TMEM258P61165 PCDHGA3-201ENST00000253812 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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TMEM258P61165 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TMEM258P61165 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TMEM258P61165 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TMEM258P61165 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TMEM258P61165 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TMEM258P61165 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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