Protein–RNA interactions for Protein: P61019

RAB2A, Ras-related protein Rab-2A, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB2AP61019 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RAB2AP61019 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms