Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB15P59190 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB15P59190 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB15P59190 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB15P59190 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB15P59190 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RAB15P59190 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RAB15P59190 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB15P59190 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms