Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ATP12AP54707 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms