Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXA1P49639 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HOXA1P49639 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms