Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PITPNBP48739 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PITPNBP48739 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms