Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NESP48681 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NESP48681 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NESP48681 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NESP48681 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NESP48681 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NESP48681 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
NESP48681 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NESP48681 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NESP48681 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NESP48681 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NESP48681 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NESP48681 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NESP48681 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NESP48681 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NESP48681 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NESP48681 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NESP48681 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NESP48681 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NESP48681 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
NESP48681 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
NESP48681 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NESP48681 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NESP48681 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
NESP48681 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
NESP48681 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NESP48681 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
NESP48681 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
NESP48681 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NESP48681 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
NESP48681 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NESP48681 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NESP48681 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms