Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRB2P47870 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRB2P47870 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRB2P47870 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRB2P47870 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRB2P47870 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GABRB2P47870 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRB2P47870 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms