Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD4P46934 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms