Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
AFMP43652 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
AFMP43652 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
AFMP43652 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
AFMP43652 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AFMP43652 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AFMP43652 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AFMP43652 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AFMP43652 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AFMP43652 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AFMP43652 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
AFMP43652 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AFMP43652 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
AFMP43652 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms