Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SNCAP37840 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCAP37840 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCAP37840 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCAP37840 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SNCAP37840 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SNCAP37840 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SNCAP37840 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms