Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CTSSP25774 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CTSSP25774 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CTSSP25774 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSSP25774 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CTSSP25774 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms