Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATP5F1P24539 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms