Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2P22307 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SCP2P22307 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SCP2P22307 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2P22307 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2P22307 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2P22307 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2P22307 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2P22307 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SCP2P22307 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SCP2P22307 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2P22307 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2P22307 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2P22307 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2P22307 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2P22307 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SCP2P22307 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms