Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CD247P20963 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CD247P20963 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CD247P20963 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CD247P20963 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD247P20963 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD247P20963 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD247P20963 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CD247P20963 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD247P20963 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD247P20963 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CD247P20963 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms