Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HKR1P10072 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HKR1P10072 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HKR1P10072 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HKR1P10072 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HKR1P10072 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HKR1P10072 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HKR1P10072 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms