Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP4K4O95819 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms