Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPFIA3O75145 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms