Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms