Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UBDO15205 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBDO15205 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBDO15205 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBDO15205 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UBDO15205 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms