Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCDC169A6NNP5 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms