Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
STRCP1A6NGW2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
STRCP1A6NGW2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms