Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
COG6Q9Y2V7 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COG6Q9Y2V7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms