Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HPSEQ9Y251 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HPSEQ9Y251 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms