Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TPCN1Q9ULQ1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TPCN1Q9ULQ1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms