Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLN8Q9UBY8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLN8Q9UBY8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms