Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RNF7Q9UBF6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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RNF7Q9UBF6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RNF7Q9UBF6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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