Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
C19orf12Q9NSK7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
C19orf12Q9NSK7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms