Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC8.57□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
KRTAP9-8Q9BYQ0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms