Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SNHG12Q9BXW3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms