Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TDRD1Q9BXT4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TDRD1Q9BXT4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms