Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VCPIP1Q96JH7 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VCPIP1Q96JH7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VCPIP1Q96JH7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VCPIP1Q96JH7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
VCPIP1Q96JH7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms