Protein–RNA interactions for Protein: Q96JG6

VPS50, Syndetin, humanhuman

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS50Q96JG6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
VPS50Q96JG6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
VPS50Q96JG6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms