Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CHMP4CQ96CF2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms