Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHST4Q8NCG5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms