Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FAM71E2Q8N5Q1 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FAM71E2Q8N5Q1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms