Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RPAP2Q8IXW5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms