Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
PLD3Q8IV08 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PLD3Q8IV08 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms