Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KRT28Q7Z3Y7 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KRT28Q7Z3Y7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms