Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C9orf135Q5VTT2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms