Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PERM1Q5SV97 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms