Protein–RNA interactions for Protein: Q5NE16

CTSL3P, Putative inactive cathepsin L-like protein CTSL3P, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSL3PQ5NE16 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTSL3PQ5NE16 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTSL3PQ5NE16 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms