Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ACSM3Q53FZ2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms