Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TPRNQ4KMQ1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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