Protein–RNA interactions for Protein: Q49AN0

CRY2, Cryptochrome-2, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY2Q49AN0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CRY2Q49AN0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CRY2Q49AN0 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms