Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBM2

TMEM176B, Transmembrane protein 176B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM176BQ3YBM2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM176BQ3YBM2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms