Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TWISTNBQ3B726 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms