Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LRRFIP1Q32MZ4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms